Un farmacoforo è un'entità che consiste dell'insieme di fattori elettronici e sterici che sono necssari a una molecola per esercitare il suo effetto farmacologico!
Non è quindi una molecola ma qualcosa di astratto, qualcosa che la molecola deve possedere e che ci aspettiamo che molecole con identico meccanismo d'azione e sito d'azione condividano. Più che all'intera molecola si riferisce a una parte della molecola, a quella che interagisce con il bersaglio.
Il farmacoforo è una buona base per iniziare una progettazione farmaceutica, è la parte essenziale, la restante parte della molecola sarà quella modificabile per migliorare aspetti farmacodinamici, farmacocinetici, tossicità, solubilità ect..
Nell'immagine possiamo vedere come più che descrivere che gruppi funzionali specifici siano necessari un farmacoforo descrive che tipo di interazione o gruppo sia necessario, ex un gruppo cationico, un gruppo aromatico.
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